我的土地确权证上写的不是基本农田，该如何处

土地确权证与国土资源局说法不一，应申请核实。依据《土地管理法实施条例》，需向县级土地行政主管部门提出申请，核实土地性质，避免土地权益受损或面临违法风险。
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处理此问题常见方式为申请核实与行政复议。应先向县级土地行政主管部门申请核实土地性质，若对结果有异议，可进一步申请行政复议，以确保权益得到公正处理。
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土地性质有异议。操作如下：1.向县级土地行政主管部门提交申请书及证明材料，申请核实土地性质。2.若核实结果与确权证不符，与国土资源局沟通，要求更正或解释。3.如沟通无果，可申请行政复议或法律诉讼，维护自身土地权益。